3.業務架構不斷強化。一方面，積極根據新時期新形勢下的政策研究與決策咨詢需要增設專業化研究部門與研究平台。如中國科學院持續深化“科技智庫”定位，增設科學前瞻與科學思想、科技政策與決策咨詢、科技創新與戰略情報等多個研究部門，同時設立咨詢研究、學科研究、科學規範與倫理研究、科普與教育研究、第三方評估研究等五個研究支撐中心作為智庫主體業務架構；中國人民大學國家發展與戰略研究院結合自身高校智庫特點，設立智庫研究平台、智庫轉化平台和公共政策論壇等三大業務板塊，在此基礎上設立調查與數據中心、社會發展與管理大數據中心、應用統計科學研究中心、公共政策實驗室等機構作為智庫信息支持平台；中國社會科學院構建“研究院—研究所—專業化智庫”三級業務組織架構，在原有研究體系基礎上著力打造“國家全球戰略智庫”“財經戰略研究院智庫”“意識形態研究智庫”等專業化獨立智庫機構。另一方面，著力促進本系統內的政策研究機構開展智庫業務交流。如國務院發展研究中心為推動政府決策咨詢系統整體水平的提升，按年度舉辦“全國政策咨詢會議”“全國政策咨詢系統幹部研修班”等活動，對提高各地政府智庫水平成效顯著；中央黨校和中國社會科學院舉辦的“全國黨校系統智庫建設座談會”和“中國社會科學論壇”等系統內會議，對促進本系統智庫建設均起到顯著促進作用。
4.人才結構加快優化。高層次人才是智庫的核心資源。自兩辦意見與國家高端智庫試點工作實施以來，各領域智庫均積極探索和優化崗位人才結構，著力構建專業性、規範性、創新性並重的智庫人才發展環境。例如，國務院發展研究中心不斷豐富智庫人才建設專項，通過實施“人才創優計劃”，重點培養政策研究領軍人才、學科領域帶頭人和青年拔尖人才，為智庫發展提供健全的人才結構層次；中國社會科學院的智庫人才培養體系分為專職、非專職、博士後、院所共建等四種類型，組成不同方向的智庫研究團隊，同時探索施行“創新研究崗位”制度，在現有專業技術職稱序列基礎上輔以創新研究崗位序列，加強進崗人員的業務競爭與待遇保障。中國宏觀經濟研究院遴選研究人員進入“國宏訪問學者計劃”，為其創造到國際知名智庫或頂尖研究型高校訪學深造的機會。
5.科研管理更加規範。一是加快改進智庫研究選題機制。以圍繞戰略、聚焦發展、服務大局、問題導向為依循，將選題工作與提高研究質量與戰略價值含量、推動內容創新等緊密結合，有效提升了研究成果的質量與政策針對性。例如，中央編譯局以馬克思主義研究部、世界發展戰略研究部等部門作為依托，將“國家治理體系和治理能力現代化”“全球治理與世界主要國家發展戰略”“當代世界與社會主義新趨勢”“馬克思主義理論與當代實踐”等方向確立為智庫研究工作重點選題領域；國家行政學院每年重點聚焦兩至三項重大綜合性研究選題，使學院的基礎科研、教學培訓、智庫等三個分支共同參與課題研究並共享成果。二是不斷完善成果考評辦法。如中央黨校相繼制定出台了智庫成果評價辦法、崗位考核管理辦法等，對研究成果從決策、學術、公眾、媒體、國際化等五類影響建立評價指標體系，形成差異化成果評價機制；中國現代國際關係研究院參考ISO質量認證體系，對研究構思、規劃、分析、研討、撰寫、採用及反饋等環節建立全流程評價機制；軍事科學院、國防大學借鑒工程領域管理理念與方法，實行“課題樹”(包括樹冠課題、主幹課題、根系課題)科研管理方式，面向不同層次開展研究成果考評。三是探索施行崗位激勵創新。如國防大學提出對政策研究能力強、成果質量突出的項目團隊和專家實施績效激勵，對其給予下階段課題優先立項權，並根據研究難易程度，對難度較大的項目給予更多經費支持，同時逐步提升“年度科研成果獎”“劉伯承科研成果獎”等獎項獎勵力度；中國宏觀經濟研究院面向全國研究人員設立“中國宏觀經濟研究創新獎”，同時對連續三年考核優秀的在職研究人員頒發“智庫建設傑出貢獻獎”，在此基礎上進一步豐富拓展海外進修、崗位培訓等激勵路徑。
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