2020年2月23日，習近平總書記在統籌推進新冠肺炎疫情防控和經濟社會發展工作部署會議上指出：“在這次應對疫情中，暴露出我國在重大疫情防控體制機制、公共衛生應急管理體系等方面存在的明顯短板，要總結經驗、吸取教訓，深入研究如何強化公共衛生法治保障、改革完善疾病預防控制體系、改革完善重大疫情防控救治體系、健全重大疾病醫療保險和救助制度、健全統一的應急物資保障體系等重大問題，抓緊補短板、堵漏洞、強弱項，提高應對突發重大公共衛生事件的能力和水平。要堅持預防為主的衛生與健康工作方針，大力開展愛國衛生運動，加強公共衛生隊伍建設和基層防控能力建設，推動醫防結合，真正把問題解決在萌芽之時、成災之前。”
2020年3月10日，習近平總書記在湖北省考察新冠肺炎疫情防控工作時強調：“我們要放眼長遠，總結經驗教訓，加快補齊治理體系的短板和弱項，為保障人民生命安全和身體健康築牢制度防線。要著力完善公共衛生應急管理體系，強化公共衛生法治保障，改革完善疾病預防控制體系、重大疫情防控救治體系，健全重大疾病醫療保險和救助制度，健全統一的應急物資保障體系，提高應對突發重大公共衛生事件的能力和水平。”
用1個多月的時間初步遏制疫情蔓延勢頭，用2個月左右的時間將本土每日新增病例控制在個位數以內，用3個月左右的時間取得武漢保衛戰、湖北保衛戰的決定性成果，進而又接連打了幾場局部地區聚集性疫情殲滅戰，奪取了全國抗疫鬥爭重大戰略成果。
2020年5月24日下午，習近平總書記在參加十三屆全國人大三次會議湖北代表團審議時說：“防範化解重大疫情和突發公共衛生風險，事關國家安全和發展，事關社會政治大局穩定。要堅持整體謀劃、系統重塑、全面提升，改革疾病預防控制體系，提升疫情監測預警和應急響應能力，健全重大疫情救治體系，完善公共衛生應急法律法規，深入開展愛國衛生運動，著力從體制機制層面理順關係、強化責任。”
“這場抗疫鬥爭是對國家治理體系和治理能力的一次集中檢驗。”2020年9月8日，習近平總書記在全國抗擊新冠肺炎疫情表彰大會上指出：“要抓緊補短板、堵漏洞、強弱項，加快完善各方面體制機制，著力提高應對重大突發公共衛生事件的能力和水平。要構築強大的公共衛生體系，完善疾病預防控制體系，建設平戰結合的重大疫情防控救治體系，強化公共衛生法治保障和科技支撐，提升應急物資儲備和保障能力，夯實聯防聯控、群防群控的基層基礎。要完善城市治理體系和城鄉基層治理體系，樹立全周期的城市健康管理理念，增強社會治理總體效能。要重視生物安全風險，提升國家生物安全防禦能力。”
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