徐遵慈認為兩岸經貿關係，這是台灣面臨的最大的挑戰和不確定性，因為大陸不斷加強對台灣的壓力，並採取了一系列的經濟反制和制裁措施。其中最引人注目的是，大陸宣布要停止執行ECFA（海峽兩岸經濟合作架構協議）中的早收清單，並對台灣的12項石化產品取消關稅優惠。這是大陸首次對台灣的工業產品進行制裁，打破了過去只對台灣的農漁產品進行制裁的慣例。這也意味著，大陸對台灣的經濟依賴度已經降低，而台灣對大陸的經濟依賴度仍然很高，尤其是在半導體產業方面。根據統計，台灣對大陸的半導體出口占台灣對大陸總出口的比例已經從2018年的31.5%上升到2023年的48.32%，而其他產業的出口則呈現緩慢或下降的趨勢。這樣的情況，不僅增加了台灣的經濟風險，也削弱了台灣的經濟競爭力。
徐遵慈認為面對大陸的經濟制裁，台灣應該回到ECFA的本質，也就是兩岸的的經濟合作，而不是兩岸的政治對立。大陸在宣布停止執行ECFA的早收清單時，也同時發布了一份24頁的貿易調查報告，其中詳細列出了大陸對台灣的貿易不滿和要求，包括台灣對大陸的進口限制、關稅壁壘、技術標準、產業補貼等。這份報告反映了大陸的真正目的，那就是要敲開台灣的市場，而不是要完全斷絕與台灣的經貿關係。因此，台灣應該從這份報告中，找出一些可以酌量開放的項目，以回應大陸的訴求，並減緩大陸的制裁壓力。當然，這些項目必須是符合台灣的利益和社會共識的，也必須是不會對台灣的本土產業造成嚴重的衝擊和威脅的。例如，台灣可以考慮開放一些大陸的農產品和工業品的進口，但是必須嚴格執行台灣的SPS（衛生和植物衛生）檢驗檢疫措施，以確保這些產品的安全和品質。同時，台灣也可以要求大陸對台灣的一些產品和服務提供更多的市場準入和保護，以實現互惠互利的原則。
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