邱世卿提到，過去基於兩岸善意，中國大陸基本上還是尊重在經濟海域或者傳統海域上兩岸雙方各自管理，彼此尊重對方在法律位階的治理權。但這個尊重在最近“海巡署”執法爭議下，平衡被打破。
他說明，金廈水域治理權本來是依靠兩岸雙方協商、善意和提出各自原則，透過談判劃定彼此管理或者管轄的區域。但自從蔡英文上台後，協商管道已經中斷，導致各自執法。過去之所以沒有問題，是因為雙方海上執法單位都保持相當克制，但這並不是在默契或善意形成的，所以一旦發生爭議事件，容易導致現狀改變。
邱世卿指出，在這次金廈水域事件中，可以發現大陸逐漸抹除了以往基於善意、彼此尊重的執法線，這後續一定會產生更多紛爭。未來可能不僅在金門、廈門或者馬祖、福州水域的執法，甚至涉及整個台灣海峽範圍。去年大陸已經示範了一次聯合警巡，3月1日也宣布展開“淨海2024”查緝走私專案行動，範圍也在台海，未來大陸海警在攔檢上若遇到台灣海巡艦艇，雙方在海上對峙時應該如何解決？
邱世卿說，在上述情境下，如果台灣不儘快釋出善意，並將雙方海上執法的界定範圍確立，恐怕埋下未來彼此在海上執法衝突的種子。若台灣海巡呼叫海軍出動軍艦支援，很快就會升級為雙方軍事對峙，態勢會從保障執法權的對峙演變為保障“主權”的對峙，很容易引發軍事衝突。而兩岸雙方軍事力量相距甚遠，對台灣而言相對不利，對台海的和平穩定同樣是負面效應。
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