上述檔案中又以省檔案館、廈門市、武夷山市、福州市檔案館收藏最多。除此之外，其它一些檔案館，如閩侯、長樂、莆田、永安、南平、建甌、鬆溪、連城、上杭、福鼎、福安、壽寧等市縣檔案館也不同程度地保存著一些涉台檔案。
林真表示，福建各地檔案館所收藏的涉台檔案文獻較為豐富。從文件種類看，主要為訓令、指令、公函、電報、代電、呈文、批文、各類報表、名册、書刊等等，多數官方公文；從內容方面看，涉及政治、經濟、社會、文化、教育等與台灣相關問題與事情，主要有三個方面的內容：一是有關台民的檔案，二是台胞抗日複台檔案，三是閩台經濟文化關係檔案。
林真認為，館藏涉台檔案具有重要的價值。福建省各級檔案館館藏涉台檔案內容十分豐富，涉及政治、經濟、社會、文教各個方面，上述檔案及其整理開發對促進和深化日據時期台灣史和閩台關係史的研究有著重要的參考價值和意義。
林真也指出，館藏涉台檔案在時間和內容上均有較大的不足。
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