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法媒:計算機制病毒3D模型或成抗疫關鍵
http://www.crntt.hk   2020-04-27 15:13:25
  中評社北京4月27日電/據參考消息網報道,法媒稱,計算機和超級計算機將有一個光榮的任務:制作新冠病毒蛋白質的3D模型。最初只有3萬台計算機,現在通過Folding@Home項目已經有超過70萬台計算機共同參與進來。該項目負責人、美國生物化學家格雷格·鮑曼高興地說:“有了這一參與勁頭而且吸引了很多個人和機構的加入,我們已經虛擬地創造了世界上最強大的計算機。”

  據法國《快報》周刊網站4月25日報道,真實情況肯定會略有不同。從科學角度講,通過Wi-Fi聯網交替進行數百萬次小量計算,遠遠比不上超級計算機集中算力完成一項任務那麼有效。另外,Folding@Home項目所宣布的每秒240億億次浮點運算能力,可能從未被完全調動并運用過。不過該項目仍能讓人們對一件事情的認知取得進展——蛋白質的模型構建,尤其是新冠病毒蛋白質模型。

  巴黎索邦大學教授讓-菲利普·皮克馬爾表示:“這方面的研究正處於爆發期。全球有數十家實驗室在進行。它們將病毒分離成很多部分,試圖以虛擬的形式來用模型表述。”

  這麼做的目的是什麼呢?是為了推進對新冠肺炎的治療。因為,要想使一種藥物有效,研究人員必須清楚藥物能在哪方面發揮作用。3D模型可以描繪出藥物發揮作用的機理,然後虛擬其與靶標(例如某種病毒)的互相作用。此後再進行體外和體內試驗。

  皮克馬爾解釋說:“截至目前,醫生們從自己的認知出發進行了一些試驗。我們則基於物理學、信息技術或化學而進行不同的研究。這種研究可以讓人們對病毒的認知更進一步,其結果也會與其他實驗室進行分享。在新冠病毒問題上,存在著這樣一種風險——盡管時間在推移,卻找不到任何有效的克制手段。這種情況過去在對艾滋病的研究上就出現過。目前艾滋病沒有任何疫苗,人們不得不依靠計算機的算力來研究預防性治療。”

  如果進行中的試驗的最後結果令人失望,計算機也許能帶來新的治療理念。皮克馬爾進一步解釋道:“一旦我們有了好的模型,就可以進行虛擬篩選,也就是找到那些能與病毒相互作用的藥物成分。”但由於存在成千上萬種可能性,模擬過程可能會耗時很久,而且精確的結果也需要很大的運算量和時間。

  此外,算力也并不是獲得成功的保障。還應當考慮到數不清的物理規律。皮克馬爾表示:“在微觀層面,我們會看到水、離子以及高能電子區的相互作用……我們對物理的認知仍有不少偏差。”

          
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